De wetgeving met betrekking tot het gebruik van genetisch gemodificeerde
micro-organismen is complex. Tevens bestaan er tussen Europa en de Verenigde
Staten verschillen in wetgeving en is er op onderdelen tussen Europese landen
verschil in interpretatie.
In sommige landen wordt alleen heterologe recombinatie onder de GGO-wetgeving
geplaatst, terwijl homologe recombinatie wordt beschouwd als een wat modernere
vorm van klassieke stamverbetering.
In Europa valt zowel de veiligheid van het eindproduct als het gebruik van
genetische modificatie als productietechniek onder de wetgeving. In de
Verenigde Staten gaat het vooral om de veiligheid van het eindproduct. Een
uitzondering hierop vormen producten die voorzien zijn van het predikaat
biologisch. Zowel in Europa als de VS geldt dat bij de bereiding van
dergelijke producten geen gebruik mag worden gemaakt van genetisch
gemodificeerde productieorganismen.
Deze complexiteit zet zich voort in de Europese wetgeving in wording op het
gebied van etikettering van voedingsmiddelen.